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使用工業上應用于啤酒生產。采用北京啤酒廠生產的1398細菌蛋白酶(枯草桿菌，中性蛋白酶，酶活力40000U／g)，其用量為大麥量的0．2％左右。添加細菌蛋白酶，可使大麥汁中的蛋白質分解作用加強，有利于啤酒的風味和提高泡沫非生物穩定性等。另外，本酶可用作面團改良劑、制革、制造蛋白水解物等。用途降低面團筋力，提高面團的可塑性及延伸性，保持清晰美觀的印花圖案。特別適用于餅干生產，使餅干更容易成型和壓花，成品更松化且降低破碎率。應用1、中性蛋白酶是一種無毒、的蛋白質，可應用于動植物蛋白的水解，AN%高，水解度高，風味佳,生產高級調味品和食品營養強化劑的HAP和HVP。

體內有些酶彼此聚合在一起，組成一個物理的結合體，此結合體稱為多酶復合體（multienzyme complex）。若把多酶復合體解體，則各酶的催化活性消失。參與組成多酶復合體的酶有多有少，如催化丙酮酸氧化脫羧反應的丙酮酸脫氫酶多酶復合體由三種酶組成，而在線粒體中催化脂肪酸β-氧化的多酶復合體由四種酶組成。多酶復合體個酶催化反應的產物成為第二個酶作用的底物，如此連續進行，直至終產物生成。

多酶復合體由于有物理結合，在空間構象上有利于這種流水作業的快速進行，是生物體提高酶催化效率的一種有效措施。

體內物質代謝的各條途徑往往有許多酶共同參與，依次完成反應過程，這些酶不同于多酶復合體，在結構上無彼此關聯。故稱為多酶體系（multienzyme system）。如參與糖酵解的11個酶均存在于胞液，組成一個多酶體系。